Composé de la Direction Générale, le Siège Social a pour fonctions : la coordination, l'animation, la supervision et le contrôle de l'ensemble des actions liées à la mise en œuvre par les établissements et les personnels, de la politique associative ainsi que des missions qui lui sont confiées par les pouvoirs publics (ARS, Conseil Régional, Conseils Généraux).

Il est au service des instances de l'Association et des établissements en ce qui concerne :
• le développement et l’animation de la vie associative,
• le soutien stratégique, méthodologique et technique des projets,
• la comptabilité et la gestion financière,
• l'information sur évolution des politiques publiques : législation – réglementation - droit - contentieux,
• la communication interne et externe (site web, revue Empan, etc.),
• l'organisation de colloques, et manifestations diverses,
• le système de réseau informatique,
• la gestion des ressources humaines, des dispositions conventionnelles, des recours juridiques et contentieux et de la paie.